这部剧讲述了清末民初时期，南国祥城恶势力横行，而捕头孔雪笠和仵作方栋利用现代科学知识与黑暗势力斗争的故事。两位正义勇敢的人物揭露了邪恶势力的真面目，唤醒了老百姓的觉醒。他们不仅解开了江湖秘术，也消除了封建迷信，最终成为生死与共的好兄弟。在斗争中，孔雪笠与酒楼老板娘相爱，但黑暗势力的阻挠几乎使他们不能在一起。然而最终老板娘冲破迷信束缚，有情人终成眷属。